Luego del sorteo realizado por la DIMAYOR, quedaron definidas las llaves de los cuartos de final de la Liga Águila I – 2017. Los equipos cabezas de serie, es decir los que clasificaron de la posición 1 a la 4, comenzarán sus series como visitantes y cerrarán en casa.

Las llaves quedaron conformadas de la siguiente manera:

Llave A

Jaguares vs. Atl. Nacional 

Llave B

Dep. Cali vs. Ind. Medellín

Llave C

América vs. Dep. Pasto

Llave D

Atl. Bucaramanga vs. Millonarios