El delantero de la Selección Colombia debutó con el Cúcuta Deportivo en 2011. Al poco tiempo, fichó por Cortuluá en donde tuvo una mayor participación que le ayudó a mostrar su excelente nivel y así, pasar por clubes como La Equidad, Livorno y Olimpo.

En 2015 conformó las alineaciones de Independiente Santa Fe y se consagró campeón de la Superliga de Colombia.

En el primer semestre de 2016, regresó a Cortuluá y marcó 19 goles. Para el segundo semestre, se oficializó como jugador de Atlético Nacional y celebró los títulos de Copa de Colombia y Copa Libertadores (2016).

Un año más tarde, hizo parte del Palmeiras de Brasil y, en su trayectoria con el club, ganó el Campeonato Brasileño. En el 2020 fichó, nuevamente en el FPC, con Junior. Allí jugó 37 partidos, marcó 23 anotaciones, la mayor cantidad de goles en su carrera profesional, y fue campeón de la Superliga de Colombia (2020).

Recordamos algunos momentos de Miguel Ángel Borja en el Fútbol Profesional Colombiano.