En la Copa Mustang II-2006, Independiente Medellín y Deportes Tolima destacaron en el grupo de 18 clubes que disputaban el título.

El primero sumó 32 puntos que lo clasificaron a las Cuadrangulares Semifinales donde cayó derrotado ante el que sería el campeón de ese semestre: Cúcuta Deportivo, por tan solo un punto.

El segundo ingresó a la etapa final como líder del «Todos contra todos» y consiguió el paso a la gran final, pero el título fue arrebatado por los «motilones», quienes se impusieron en el marcador global 2-1.

John Charria (Deportes Tolima) y Diego Álvarez (Independiente Medellín) fueron protagonistas, los delanteros alzaron con el botín de oro con 11 anotaciones. Sus clubes fueron los más goleadores con 42 y 41 tantos, respectivamente.

Acá un recuerdo de los artilleros: